Het Nationale Ballet gaat per 1 janauri 2013 fuseren met De Nederlandse Opera en Het Muziektheater Amsterdam. De drie organisaties, die al jarenlang nauw samenwerken, sluiten hiermee een proces af dat jaren geleden in gang gezet is, en is niet ingegeven door de bezuinigingen op cultuur. Met de fusie wordt een landelijk stichting voor opera en ballet gecreëerd. Het Nationale Ballet en de Nederlandse Opera zullen als merknaam blijven bestaan, het Muziektheater niet. De naam voor de nieuwe stichting wordt nog bekend gemaakt.Door de samenwerking kan de organisatie slagvaardiger en efficiënter optreden. Er zullen geen mensen ontslagen worden, en de budgetten voor de drie organisaties blijven gescheiden. De nieuwe organisatie wordt geleid door een driehoofdige directie, bestaande uit een algemeen directeur, een directeur opera en een directeur ballet. De huidige artistiek directeuren van De Nederlandse Opera en Het Nationale Ballet, respectievelijk Pierre Audi en Ted Brandsen, worden de directeuren opera en ballet. De algemeen directeur wordt nog aangesteld.